Основной целью деятельности Университета является содействие развитию системы здравоохранения Республики Казахстан, путем создания необходимых условий для получения качественного образования, направленных на формирование, развитие и профессиональное становление личности на основе национальных и общечеловеческих ценностей, достижений науки и практики. Основными предметами деятельности Университета являются высшее образование, деятельность больниц широкого профиля, специализированных больниц и других лечебных учреждений, имеющих стационары и общую врачебную практику.

Для реализации поставленных целей в Университете осуществляются следующие виды деятельности:

• Подготовка кадров по образовательным программам высшего и послевузовского образования, а также научно-техническую, инновационную деятельность, научно-исследовательские работы, включая фундаментальные и прикладные научные исследования;
• Реализация общеобразовательных учебных программ начального, основного среднего и общего среднего образования, а также образовательных программ технического и профессионального, послесреднего, дополнительного образования;
• Организация и проведение спортивных и культурно-массовых мероприятий;
• Издательская и полиграфическая деятельность для обеспечения образовательного процесса, исследований, воспитательной и социально-культурной деятельности;
• Организация и участие в различных мероприятиях международного и республиканского уровней: в олимпиадах, соревнованиях, конкурсах, конференциях, семинарах среди обучающихся и педагогических работников;
• Подготовка обучающихся к воинской службе по программе офицеров запаса;
• Создание технополисов, технопарков, бизнес-инкубаторов, инновационных центров, центров коммерциализации и трансферта технологий, проектных конструкторских бюро и других структур по профилю деятельности;
• Участие в разработке, апробации и внедрении инновационных методов, технологий обучения и исследований, направленных на дальнейшее развитие и совершенствование системы образования и науки;
• Организация, создание и развитие цифровых интерактивных образовательных ресурсов и учебных фильмов для всех уровней образования;
• Участие в интеграции образования и науки с производством;
• Организация, финансирование опытно-конструкторских работ, инновационных и инвестиционных проектов с привлечением финансовых ресурсов дочерних и других организаций Республики Казахстан и зарубежных организаций, а также участие в формировании механизмов и инфраструктуры венчурного финансирования проектов в области образования и науки;
• Оказание доврачебной, квалифицированной, специализированной, медицинской помощи, медико-социальной помощи и медицинских услуг;
• Оказание амбулаторно-поликлинической, высокотехнологичных первичной медико-санитарной, консультативно-диагностической, стационарной, стационаро-замещающей, скорой медицинской помощи и санитарной авиации, традиционной медицины, народной медицины (целительство) населению, в том числе иностранным гражданам и лицам без гражданства;
• Экспертная деятельность в области образования, науки и здравоохранения, по направлениям деятельности Университета;
• Организация методической и консультативной помощи по направлениям деятельности Университета;
• Медико-социальная, медицинская реабилитация;
• Проведение доклинических, лабораторных и клинических испытаний медицинских препаратов, перевязочных материалов, изделий медицинского назначения в рамках научно-исследовательской деятельности;
• Санитарно-гигиеническое обследование объектов различного назначения.