Одной из оптимальных задач использования масс-спектрометров класса Microflex является система идентификации и классификации микроорганизмов MALDI Biotyper - быстрая и надежная система для идентификации микроорганизмов. Технологии MALDI Biotyper позволяют идентифицировать как бактерии (грамположительные, грамотрицательные), так и дрожжи, а так же многоклеточные грибы без сложной системы пробоподготовки. Принимая во внимание то, что большая часть белков бактериальных клеток в стадии логарифмического роста пред- ставлены рибосомальными белками, которые в свою очередь кодируются 16S РНК, определение белковых масс-спектров позволяет получать информацию о последовательностях 16S РНК, рассматривающийся на современном этапе в качестве основного таксономического маркера вида.

Анализ проходит в одну стадию, и за несколько минут исследователь имеет возможность получения исчерпывающего результата по видовой идентификации микроорганизмов. MALDI Biotyper применяется для медицинского контроля, пищевого и ветеринарного, а так же в микробиологических лабораториях для идентификации микроорганизмов.

MALDI Biotyper - это компактный и надежный настольный прибор нового поколения для идентификации микроорганизмов от Bruker Daltonics, преимущества которого:

Простая пробоподготовка;

Быстрота;

Надежность;

Точность и воспроизводимость;

10⁵ клеток достаточно для высокоточной идентификации;

Идентификация происходит по протеому методом «отпечатка пальца»;

Работа с базой данных «Ready-to-Go»;

Доступное программное обеспечение;

Математическая обработка с применение кластерного анализа.

Технические возможности современных приборов позволяют на одном образце проанализировать несколько субпопуляций клеток по набору морфологических характеристик и флуоресценции нескольких видов.

Основные клинические направления включают в себя как уже рутинные технологии, так и перспективные, которые охватывают множество областей. Это и клиническая иммунология, аллергология, трансплантология, онкогематология и инфекционные заболевания. С помощью метода выявляют нормальные и патологические поверхностные маркеры на клетках крови, клетках костного мозга, есть методики использования клеток солидных опухолей и тканей после специальной обработки и гомогонезации.

Основными примерами использования являются определение параметров клеточного иммунного статуса, как основных популяций, так и малых субпопуляций (Т-хелперы 1 и 2 типа, Т-регуляторов, α и γ Т-лимфоцитов, наивные лимфоциты и клетки-памяти). Кроме количества возможно провести цитометрический анализ функциональной способности клеток (фагоцитоз, апоптоз, маркеры активации, в том числе тест на сепсис). Цитометрия позволяет проводить тест активации базофилов, типирования HLA (CrossMatcH), анализ плоидности ДНК.

Формально, возможности проточной цитометрии определяются возможностями установки флюоресцентной метки на исследуемых микроскопических объектах за счет высокоаффинных антител с одной стороны, и огра- ничиваются физическими размерами анализируемых частиц с другой сторо- ны. Но даже в этих жестких рамках аналитические возможности проточной цитометрии представляются чрезвычайно широкими, от анализа микрочастиц и оценки механизмов апоптоза клеток, до исследования механизмов иммунного регулирования и молекулярного транспорта.

Таким образом, достигается высокий выход и превосходная чистота. Очищение ДНК и/или РНК является одним из наиболее распространенных методов подготовки образцов, стандартным приемом в молекулярной биологии и медицинской диагностике.

Рекомендуется использование прибора при высокопотоковых исследованиях с необходимостью высокоэффективного выделения РНК/ДНК.

Возможности системы:

Программирование работы прибора по на базе ПК.

Обеззараживание интегрированная УФ-лампа

Количество образцов до 96, каждый объемом до 1000 мкл. Принцип работы с жидкостями - 96-канальная головка пипеточного дозатора с герметичным наконечником.

Прибор позволяет вести контроль температуры с изменением режимов инкубирования за счет наличия автоматизированной позиция нагревания.

Передающее место имеет 5-функциональных позиций в приборе.

Линейная, передвижная 3-позиционная платформа.

Принцип экстракции основан на магнитных и парамагнитных частицах

Этап лизиса автоматизированный, в приборе (в зависимости от исходного материала)

Формат блока: 96 образцов/384 образца

Тип пробирок: 96-луночный планшет или пробирки по 0.2 мл (отдельно или в стрипах)/384- луночный планшет

Количество каналов: 6

Объем реакционной смеси 10-50 мкл

Диапазон температур: 0-100°С: температурная точность: ±0.2 °С;

Температурная однородность: ±0.4 °С через 10 сек после старта при 90 °С

Средняя скорость: 3.3°С/сек Диапазон градиента: 30-100°С

Тип детекции флюоресценции: 6 высокочувствительных фотодиодов с фильтрами

Тип возбуждения флюоресценции: 6 светодиодов с фильтрами

Диапазон возбуждения флюоресценции: 450-684 нм

Диапазон детекции флюоресценции: 515-730 нм

Регистрация FRET: есть

Возможность HRM анализа Отображение данных в режиме реального времени.

Возможность количественного определения продуктов амплификации.

Возможность использования универсальных пробирок для ПЦР объемом 0,2 мл, с плоской и выпуклой крышкой.

Диапазон рабочих температур не менее 25-99^оС.

Возможность детекции флуоресцентного сигнала не менее чем по 6 (шести) каналам измерения флуоресценции непосредственно в ходе одной реакции амплификации отсутствие необходимости проведения калибровочных процедур в процессе эксплуатации запрашиваемого термоциклера.

Возможность изменения программы амплификации непосредственно в процессе работы.

Реакционные блоки разных форматов - 96 х 0,1 мл; 96 х 0,2 мл, а так же блок 384 х 0,02мл (только QuantStudio 5).

VeriFlex™ блок (на элементах Пельтье) позволяет производить точный контроль температуры в каждом независимом блоке.

Программируемая пауза.

Скорость изменения температуры блока до 6,25 °С.

4 канала детекции QuantStudio 3 и до 6 независимых каналов QuantStudio 5

Большой сенсорный дисплей

Компактный размер

Wi-Fi модуль и возможность работы в «облаке» (ThermoFisherCloud)

Заводская калибровка

Готовые наборы для анализа экспресии генов, SNP генотипирования, анализа копийности генов, детекции мутаций (castPCR) и определения количества микроРНК на основе технологии TaqMan

Большое количество приложений (экспрессия генов, генотипирование, определение копийности генов, HRM, анализ кривых плавления белка, профилирование микроРНК, детекция мутаций - castPCR)

Приложения

Анализ экспрессии генов (более 1,3 млн готовых наборов TagMan, так же возможен синтез праймеров и зондов под заказ)

SNP-генотипирование (более 4,5 млн готовых наборов TagMan для человека и мыши, так же возможен синтез праймеров и зондов под заказ)

Оценка копийности генов (более 1,6 млн. готовых наборов TagMan для человека, более 180 тысяч наборов для мыши).

Профилирование микроРНК

Анализ метилирования

HRM-анализ

Детекция мутаций

castPCR (конкурентноспособная аллельспецифичная технология).

Изучение метаболизма лекарственных средств 

Особенности:

Масштабируемость эксперимента. С 5-ю быстрозаменяемыми термоблоками можно анализировать 1 до 12 000 точек данных за один запуск прибора в зависимости от задач эксперимента. Используемые форматы термоблоков: 96-луночный, 96-луночный Fast, 384-луночный, а так же плашки формата TaqMan и слайды OpenArray.

Ультравысокая производительность. Используя слайды Open Array для геномных скрининговых программ, можно получать до 110 000 точек данных за рабочий день.

Готовые наборы для анализа экспрессии генов, SNP генотипирования и анализа копийности генов на основе технологии TaqMan.

Большое количество приложений (экспрессия генов, генотипирование, определение копийности генов, HRM, анализ кривых плавления белка, профилирование microRNA, цифровая ПЦР).

6 независимых каналов с фильтрами эмиссии/возбуждения позволяют получать большое количество комбинаций (до 21 комбинации).

Сенсорный дисплей позволяет проводить быструю настройку и запуск системы без использования компьютера.

Уменьшение расхода образцов и снижение затрат на реагенты благода- ря использованию нанолитровых объемов (блоки формата Open Array).

Возможность проведения цифровой ПЦР (digital PCR) при использова- нии технологии OpenArray.

Приложения

Анализ экспрессии генов (более 1,3 млн готовых наборов TaqMan, так же возможен синтез праймеров и зондов под заказ).

SNP-генотипирование (более 4,5 млн готовых наборов TaqMan для человека и мыши, так же возможен синтез праймеров и зондов под заказ).

Оценка копийности генов (более 1,6 млн. готовых наборов TaqMan для человека, более 180 тысяч наборов для мыши).

Цифровая ПЦР (детекция редких событий, мутаций, вирусной нагрузки, ГМО).

Профилирование микроРНК.

HRM-анализ.

Данная технология позиционируется как система с высокой скоростью анализа результатов с высоким разрешением, при сохранении высокой чувствительности и воспроизводимости, которая полностью заменяет процесс анализа результатов постПЦР. Расширенная версия LabChip позволяет анализировать не только нуклеиновые кислоты (ДНК, РНК), но и белки, включая не только количественное и качественное определение пептидов, но и возможность анализа паттернов гликозилирования моноклональных антител, что является актуальным в иммунологических исследованиях.

Чипы и реагенты для анализа ДНК и РНК

Общий диапазон разделения 25 – 12000 п.о.

Чувствительность от 10 пг/мкл

Время анализа – от 30 до 80 сек для 1 образца в зависимости от вида анализа

Чипы и наборы реагентов продаются отдельно

Многоразовые чипы – каждый чип рассчитан на работу с 2000 образцами, чип для геномной ДНК рассчитан на 500 образцов

2 вида чипов для анализа нуклеиновых кислот

Наборы реагентов для анализа ДНК рассчитаны в среднем на 2000 образцов (20 96-луночных планшетов), набор реагентов для анализа РНК – на 1000 образцов

Система ArcturusXT™ Laser Capture Microdissection (LCM) System состоит из инструмента ArcturusXT. Компьютера и программного обеспечения ArcturusXT.

О лазерной микродиссекции:

Лазерная микродиссекция это метод получения отдельных популяция клеток из образцов препаратов с использованием ИК лазера малой мощности для активации специального термопластичной пленки над образцом.

Активированная переводная пленка прилипает к клеткам, которые расположены в пределах диаметра лазерного луча. Лазер не влияет на образцы ткани, не нарушает качество нуклеиновых кислот и белков в составе образца и морфологию клеток.

Лазерная захватывающая микродиссекция (ЛЗМ) позволяет избежать повреждений морфологии клетки и еѐ химического состава, что делает этот метод оптимальным при изучении ДНК, РНК, белкового состава клетки.

Характеристики системы:

Это наиболее мягкая техника диссекции клеток или молекул, способствующая сохранению их целостности, возможность работы со стволовыми клетками.

Самый лучший выбор для выделения одиночных или небольшого количества клеток.

Вырезание УФ лазером (UV Laser Cutting)

Обеспечивает дополнительную скорость и гибкость

Идеально подходит при работе с сухими тканями и большим количеством клеток

Система от Applied Biosystems® ArcturusXT™ LCM, позволяет:

Осуществлять микродиссекцию живых клеток непосредственно с чашки

Петри:

Изолирование определенных клеток из смешанной культуры.

Разделение разных типов клеток с последующим их культивированием с целью получения чистой культуры.

Отделение стволовых клеток.

Изолирование субкультуры недифференцированных клеток.

Изолирование дифференцированных клеток для исследования генома или протеома.

Изолирование трансфецированных клеток для изучения in vivo.

Изоляция клеток для клонирования.

Возможность работы с замороженными и парафинированными образцами.

Получать изображение клеток:

Nikon Eclipse Ti-E оптика специально преобразована и адаптирована для научно-исследовательских целей.

Возможность сочетания различных методов контраста микроскопирования фазового и дифференциально-интерференционного.

Камера и система просмотра изображений высокого разрешения.

Возможность использования бинокуляра для стандартного микроскопирования.

Непосредственное измерения линейных размеров объекта на экране

Может применяться для сравнительного секвенирования, для обнаружения и подтверждения наличия мутаций и SNP, STR-, AFLP- и SSCP-анализов.

Число капилляров: 8

Длина капилляров (см): 36 или 50

Тип полимера: POP-4™, POP-6™, POP-7™

Количество одновременно детектируемых флюоресцентных меток (длина волны испускания): 5 (525 – 650 нм)

Длина прочтения: более 850 нуклеотидов

Производительность прибора: 1272 форезов за сутки при использовании ко- роткого капилляра и полимера POP-7

На каждом планшете допускается совмещение до 12 различных тест систем. Ограничением являются времена и температуры инкубации.

Внесение образцов и контролей в лунки микропланшета с требуемой точностью. Предусмотрена возможность предварительного разведения исследуемых образцов во внешних пробирках или специальных планшетах с объемом лунки 1мл. Максимальная степень разведения 1:10000.

Внесение образцов, контролей/стандартов и реагентов в лунки микропланшета с требуемой точностью.

Контроль на всех этапах операции внесения образцов, контролей/стандартов и реагентов. Автоматическое измерение уровня жидкости в образце, а также детекция сгустков кондуктометрическим методом. Контроль внесения образцов и реагентов в лунки микропланшета с помощью регистрации изменения в них оптической плотности.

Выполнение высокоэффективной промывки микропланшета для обеспечения минимального значения остаточного объема. Допускается использование 3 различных промывающих растворов в одной постановке.

Выполнение процедуры инкубации микропланшетов при высокоточном регулировании температуры. Предусмотрена возможность шейкирования планшета в процессе инкубации.

Проведение измерения коэффициента поглощения (Оптической плотности) в лунках микропланшета.

Автомат может выдать до 380 результатов за 3-4 часа, но производительность зависит от специфики протоколов разных анализов, используемых в автомате.

Иммуноферментный анализ является одним из базовых анализов в современной лабораторной диагностики и ассортимент возможных тестов очень велик, это и гормоны, цитокины, антитела и антигены инфекционных возбудителей и паразитов, антитела к аутоиммунным заболеваниям и медиа- торы патологических процессов. Ифа-робот является открытой системой и на нем возможно использовать тест-системы любых производителей.

Программирование робота посредством специализированного программного обеспечения, работающего под управлением Windows.

Пипетирующий LiHa и транспортировочный RoMa манипуляторы

Конфигурация наконечников (4 многоразовых тефлоновых наконечника)

Объемы дозирующих шприцев 200мкл

Считывание штрих-кода с образцов, реагентов, микропланшетов

Шейкер темостат

Спектрофотометр Sunrise

Вошер

Открытая платформа для реагентики и используемой посуды

Наличие штативов с поддержкой лабораторной посуды различных производителеq (Vacutainer, Eppendorf, Nunc, Labsystems).

Данный роботизированный комплекс позволяет произвольно модифицировать рабочее поле, имеет свободную конфигурацию для дальнейшего развития станции за счет установки модулей расширения (www.tecan.com). Робот имеет упрощенную систему программирования построенную на дружественной визуальной системе программирования, включающей язык программирования высокого уровня.

Технические характеристики робота:

Ширина рабочего поля – 150 см

Манипулятор LiHa c 4 диллюторами (расширяемо до 8) по 300 мкл.

Произвольная конфиграция рабочего стола

Возможность работы с широким спектром лабораторной посуды

Свободное программирование 3D-геометрии

Возможность работы с одноразовыми наконечниками на 10, 50, 300, 1100 мкл

Открытая архитектура, позволяющая произвольно изменять функцио- нальность робота и интегрировать его в любой лабораторный произ- водственный цикл.

В составе электрофоретического комплекса имеется препаративная ка- мера с перистальтическим насосом и системой фракционирования, интегри- рующейся с системой очистки на колонках высокоэффективного жидкостного хроматографа.

Rotofor Cell System. Прибор для разделения белка из растворов путем жидкофазного препаративного изоэлектрофокусирования. Разделяет смесь комплекса белков в 20 отдельных фракциях путем ИЭФ. Обрабатывает до грамма белка и эффективно концентрирует белки, т.е. это эффективный метод для получения слабосвязанных белков. Для стабилизации электрорезной системы используется «низктемпературная водянная баня» позволяющая поддерживать температурный режим в форезной камере 5-10 градусов С.

Gel Doc XR+ (BioRad) – система гель-документирования проста в использовании, обладает Gel Doc XR+ высоким разрешением и высокой чувствительностью при детекции хемилюминесцетных красителей или 2D гелей высокого разрешения. Оптимизирует воспроизводимость и надежность экспериментальных данных, что позволяет проводить количественное сравнение различных экспериментов. Система Gel Doc XR+ снабжена CCD камерами высокого разрешения и специализированным программным обеспечением с широкими функциональными возможностями.

Комбинация системы изоэлектрического фокусирования Rotofor Cell System и ячеек mini-Protean а также 20-см электрофоретической камеры Helicon позволяет на нашей реализовать технологию 2D-электрофореза, являющуюся одним из основных инструментов протеомных исследований. При этом есть возможность не только поиска отдельных маркерных белковых молекул, их визуализации самыми разнообразными методами (при использовании системы GelDoc XR+ фирмы BioRad), но и идентификации белков как с использованием технологии MALDI-TOF (Microflex, Bruker), так и комбинации ВЭЖХ комплекса Infinity 1260 (Agilent) с квадрупольным массспектрометром (ESI) и коллектором белковых фракций. Подобная комбинация технологический решений для анализа белков создает поистине уникальные возможности проведения исследовательских работ в области понимания функционирования непознанной вселенной, называющейся протеом.

Система для ИЭФ на стрипах Hoefer IEF 100

Система предназначена для первого направления разделения в 2D- электрофорезе – изоэлектрофокусировки на стрипах

Производительность – до 6 стрипов длиной от 7 до 24 см, до 12 стрипов длиной 7 см

Управление системой и мониторинг: LED-монитор и кнопочная клавиату- ра на панели прибора

Встроенный источник питания: до 12000 В, до 10 мА, до 10 Ватт

Встроенный термостатирующий элемент: температура +15 – +25 гр. С

Комплект включает все аксессуары, необходимые для работы (бумажные электроды, 2 трея для регидратации стрипов, трей для ИЭФ, колпачки для нанесения образца, щетка для чистки, пинцет)

Вертикальная камера SE600 Large Format для второго направления 2D- электрофореза — камера для электрофореза белков в полиакриламидных гелях

Формат камеры – вертикальный большой формат, для разделения с высоким разрешением, для второго направления разделения в 2D-электрофорезе

Размер гелей 25 х 20 см

Камера предназначена для работы с гелями заливаемыми вручную

Основные характеристики:

Вместимость 1-6 гелей

Камера включает теплообменник с подключением к внешнему рециркуляционному термостату, позволяет поддерживать постоянную температуру в процессе разделения в диапазоне от +1 до +45 гр. С

Конструкция позволяет повторно использовать электрофорезный буфер

Для заливки гелей необходимы:

Заливочный стенд на 7 гелей

Стеклянные кассеты со спейсерами толщиной 1 мм

В составе нашей лаборатории имеется два хроматографа, которые в полной мере позволяют использовать возможности современной хроматографии в самом широком диапазоне: от смесей соединений с низкими температурами кипения до макромолекулярно-белковых смесей. Представленные модели хроматографов в качестве детектирующих модулей используют масс-спектрометрические анализаторы с высокопроизводительными программно- аппаратными комплексами с обновляемыми химическими базами данных.

Газовый хроматограф Agilent 7890

Agilent 7890A обеспечивает проведение качественного и количественного анализов сложных смесей органических соединений, а также смесей газов в широких диапазонах концентраций. Пятое поколение системы управления потоками газов, а также быстродействующая электроника, применѐнная в хроматографе, позволила установить новый стандарт точности фиксации времен удерживания, что делает новый газовый хроматограф Agilent 7890A самой надежной системой из всех использовавшихся ранее.

В конструкции нового монолитного модуля управления потоками газов используется минимальное количество кольцевых уплотнений, что обеспечивает уникальную надѐжность работы этого важнейшего узла хроматографа.

Еще более быстрое охлаждение термостата, технология обратной продувки колонок, усовершенствованные методы автоматизации и быстрый нагрев узлов ГХ/МС системы, позволяют Вам сделать больше за меньшее время, по самой низкой стоимости анализа образца. Гибкий дизайн электронной системы управления расходами газов позволяет реали- зовать еще более сложные методы анализа углеводородов, чем раньше. Дополнительный третий детектор (детектор по теплопроводности) может заметно ускорить сложные исследования при анализе газов, а также позволяет выполнить еще больше различных типов анализов на одном приборе.

Автосемплер

Датчик электронного захвата

Трехосный масс-спектрометрический детектор

Высокоэффективный жидкостной хроматограф Agilent 1260 Infinity

С помощью хроматографов Agilent 1260 Infinity можно реализовать любую методику, связанную с разделением самых сложных смесей, в самом широком диапазоне концентраций и в самом широком масштабе - от микро- и, даже, нано-граммовых количеств - до препаративных, измеряемых сотнями миллиграммов или даже граммами.

Повышение значения рабочего давления с 400 до 600 бар и частоты сбора данных до 80 Гц, а также применение колонок с размером зерна сорбента менее 2 мкм, дало возможность пользователям модели Agilent 1260 Infinity работать, как в традиционной ВЭЖХ, так и в области ультра-высокоэффективной жидкостной хроматографии (УВЭЖХ).

Система диагностики течей;

Соединение всех блоков при помощи LAN-интерфейсов (внутри-приборная компьютерная сеть коммуникаций);

Уникальная система РЧ-идентификации колонок, ламп, проточных кювет и кранов;

Удобный фронтальный доступ ко всем ключевым узлам хроматографа, требующих периодической замены (лампы, кюветы, краны и пр.);

Хорошо зарекомендовавшие себя системы самодиагностики и система оповещений о необходимости проведения профилактических работ (EMF).

Автосемплер

Квадрупольный масс-спектрометрический детектор (ESI)

Несомненными преимуществами данного хроматографического комплекса является возможность дополнения его уже имеющимися в составе лаборатории другими технологическими решениями, что создает широкие возможности для проведения высокоэффективных скрининговых исследований, охватывающих широкий спектр мишеней от отдельных точечных мутаций до множественных генных ансамблей; от структурных модификаций полипептидных цепей до новых патогенетических путей, включающих множественные белковые взаимодействия.