1949 жыл 5 желтоқсан – КСРО Министрлер Кеңесі Төрағасының бұйрығымен таратылған Қазан стоматологиялық институтының профессорларын, оқытушыларын, сондай-ақ 1 курс студенттерін Қарағанды ​​медицина институтына ауыстыру туралы қаулы шықты. 1950 жылы 1 қыркүйекте Қарағанды ​​медицина институты алғашқы 127 студентке есігін айқара ашты. Жалғыз медицина факультетінде 11 кафедра, 23 оқытушы, оның ішінде 3 ғылым докторы және 3 ғылым кандидаты бар. 1952 ж.- аспирантура мен ординатура ашылды.1955 ж.- Қарағанды ​​медицина институты алғаш рет алты жылдық оқу жоспарын толық көлемде аяқтап, алғашқы түлектерді – 94 дәрігер шығарды. Олардың 15-і университетті үздік бітірген. 1957 жылы институт Ғылыми кеңесте кандидаттық диссертация қорғау құқығын алды.

1961 жылы институтқа бірінші разряд берілсе, бір жылдан кейін педиатрия факультеті ашылды. 1967 жылы акушерия және гинекология, адам анатомиясы, ішкі аурулар, патологиялық физиология, хирургия, биологиялық химия деген ғылыми мамандықтардың тізімі бекітілді, соған сәйкес ҚарМИ Ғылыми кеңесіне кандидаттық диссертацияларды қорғауға қабылдауға және академикті марапаттауға рұқсат етіледі. медицина ғылымдарының кандидаты ғылыми дәрежесі. Барлығы 1958-1972 жылдар аралығында медицина ғылымдарының кандидаты ғылыми дәрежесін алу үшін 186, медицина ғылымдарының докторы ғылыми дәрежесін алу үшін 23 диссертация қорғау жүргізілді.

1974 жылы ғылыми-зерттеу секторы (ҒЗЖ) құрылды, ал 2 жылдан кейін ол тапсырыс бойынша дайындалған ғылыми және практикалық тақырыптардың сенімді серіктесі және жоғары білікті орындаушысы беделіне ие болды. 1978 жылы стоматология факультеті ашылды. Қарағанды медицина институтының профессорлық-оқытушылық құрамы Кеңес Одағы бойынша орташа деңгейден жоғары деңгейде ғылыми дәрежесі бар жоғары білікті ғылыми-педагогикалық кадрларды қамтыды. Бірқатар жаңа бөлімдер ашылып жатыр.

Орта медицина қызметкерлерін даярлайтын факультет ұйымдастырылды. Медициналық және фармацевтикалық жоғары оқу орындары, дәрігерлердің біліктілігін арттыру институттары арасындағы 1985 жылға және жалпы XI бесжылдыққа арналған Бүкілодақтық социалистік жарыста Қарағанды мемлекеттік медицина институты КСРО-ның медициналық жоғары оқу орындары арасында екінші орынды иеленді. Қол жеткізген жетістіктері үшін Министрліктің Құрмет грамотасы және ақшалай сыйлық берілді.

1990 жылы қазақ бөлімшесі ашылды. 1991 жылы ғылыми-зерттеу орталығы құрылды. Медициналық, педиатриялық және санитарлық-гигиеналық факультеттердің студенттерін теориялық оқытудың бір кезеңі ретінде шетел азаматтарына арналған дайындық бөлімі және жалпы емдеу факультеті пайда болды. 1992 жылы медицина-биология факультеті ашылып, оқытуға арналған бағдарламалық-техникалық қамтамасыз ету кафедрасының негізінде ақпараттық-есептеу орталығы ұйымдастырылды. 1993 жылы институтта дәрігерлер мен фельдшерлердің біліктілігін арттыру факультеті жұмыс істей бастады. 1997 жылы Қарағанды мемлекеттік медицина институты Қарағанды мемлекеттік медицина академиясы болып өзгертілді. 1999 жылы шетел азаматтары үшін деканат базасында шетелдік студенттерді оқыту үшін халықаралық ынтымақтастық бөлімі құрылды.

2001 жылы шетел студенттері үшін ағылшын тілі бөлімі ашылды. 2002 жылы фармацевтика факультеті, шығыс медицинасы факультеті және медицина колледжі пайда болды. 2002 жылы университет медициналық қызметті жүзеге асыруға лицензия алды. Стоматологиялық емхана ашылды. Сол жылы студенттер студенттік емханада медициналық көмек алу мүмкіндігіне ие болды. Республикадағы бірінші университеттік оқу-клиникалық зертхана жұмыс істей бастады. 2005 жылы университет ТМД елдерінде бірінші болып NQA-UK, NQA-Russia уәкілетті органының сапа менеджменті жүйесін сертификаттаудан өтті.

2010 Қарағанды мемлекеттік медицина университеті IQAA рейтингі бойынша Қазақстандағы ең үздік медициналық жоғары оқу орны болып танылды, сонымен бірге университет институционалдық аккредитациядан сәтті өтті. 2009 ж.: «Қарағанды мемлекеттік медицина академиясы» «Қарағанды мемлекеттік медицина университеті» болып өзгертілді. 2011 жылы университет аралық мемлекеттік бақылау қорытындысы бойынша Қазақстан ЖОО арасында бірінші орынды иеленді. 2011 жылы университет Дүниежүзілік денсаулық сақтау ұйымының (World Directory of Medical Schools, WHO) Авиценна медициналық мектептерінің анықтамалығына енгізілді. 2012 ж. – ҚММУ «Медицина», «Қоғамдық денсаулық сақтау», «Фармация» мамандықтары бойынша PhD-докторантура бағдарламалары бойынша білім беру қызметін жүргізу құқығын алды. 2007 жылы ҚММА алғаш рет «Қазақстан Республикасында медициналық және фармацевтикалық білім беруді реформалау тұжырымдамасын (2007-2009) іске асыруды ғылыми қамтамасыз ету» ғылыми-техникалық бағдарламасы аясында медициналық білім беру саласында зерттеулер жүргізді. .” Бұл ретте университет Қазақстан Республикасы Білім және ғылым министрлігінің ЖОО рейтингіне алғаш рет қатысып, еліміздегі медициналық жоғары оқу орындары арасында бірінші орынды иеленіп отыр.

2016 жылы ортопедия саласындағы өнертабысқа Еуразиялық патенттік ведомствоның бірінші еуразиялық патенті алынды. ҚММУ Ғылыми-зерттеу орталығының Ғылыми-зерттеу санитарлық-гигиеналық зертханасы ҚР СТ ISO/IEC17025-2007 талаптарына сәйкестігіне аккредиттелген.

2017 жылы ҚММУ медициналық ЖОО арасында ғылыми нәтиже көрсеткіштері бойынша 1 орынға ие болды; Қазақстан Республикасы медициналық ЖОО-ның жалпы институционалдық рейтингінде II орын; «Жалпы медицина» мамандығы бойынша білім беру бағдарламалары рейтингінде I орын.

ҚММУ Қазақстан Республикасының жоғары оқу орындарында кәсіпкерлік білім беруді енгізу бойынша еуразиялық жобаға қабылданған жалғыз медициналық университет болып табылады. 2017 жылы университет студенттері Қазақстан Республикасының студенттерінің инновациялық жобалары арасындағы Makeathon байқауының қорытындысы бойынша 1 жүлделі орынға ие болды.

Университет ЕО-ның 3 грантын жеңіп алды Erasmus+ бағдарламасы үш жоба бойынша: «Еңбек және қоршаған ортаны қорғау саласындағы магистрлік бағдарламаларды үйлестіру және өзара тану», HARMONEE (2020 – 2023); «Қазақстандағы жоғары білім беру жүйесінде магистратура және докторантура деңгейлерінде мейірбике ісін дамытуды жеделдету», AccelEd (2020 – 2023); «21-ші ғасыр дәрігерінің дамуына жәрдемдесу: пациентке бағытталған қарым-қатынас дағдыларын үйрету», FOR21 (2020 – 2023).

«Жалпы медицина» университетінің білім беру бағдарламалары «Атамекен» ҰКП рейтингінде 1 орынға ие болды., «Стоматология» және «Фармация».

Университеттің негізгі сертификаты – оның түлектері. 33 мыңнан астам жоғары білікті дәрігер Қазақстанның барлық аймақтарында, жақын және алыс шетелдерде табысты және жемісті еңбек етуде. Ал бүгінде «ҚМУ» КЕАҚ сапалы оқыту дәстүрінің, білім, ғылым және тәжірибенің бірлестігі, халықаралық деңгейде танылу, заман талабына сай мамандар даярлау ісін ұдайы жетілдіру тарихын жазуды жалғастыруда.